Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATL2Q8NHH9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
ATL2Q8NHH9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms