Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR7

CCDC148, Coiled-coil domain-containing protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC148Q8NFR7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CCDC148Q8NFR7 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCDC148Q8NFR7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms