Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAV1

PRPF38A, Pre-mRNA-splicing factor 38A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38AQ8NAV1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRPF38AQ8NAV1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRPF38AQ8NAV1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms