Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3J3

C17orf53, Uncharacterized protein C17orf53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf53Q8N3J3 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C17orf53Q8N3J3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C17orf53Q8N3J3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms