Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SKAP1Q86WV1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SKAP1Q86WV1 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms