Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RBBP6Q7Z6E9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RBBP6Q7Z6E9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms