Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APTXQ7Z2E3 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APTXQ7Z2E3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms