Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
KNDC1Q76NI1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
KNDC1Q76NI1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms