Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPOCD1Q6ZMY3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms