Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWJ1

TMCO3, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO3Q6UWJ1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TMCO3Q6UWJ1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
TMCO3Q6UWJ1 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
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