Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZ36

FAAP20, Fanconi anemia core complex-associated protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20Q6NZ36 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
FAAP20Q6NZ36 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms