Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXP0

EFCAB12, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB12Q6NXP0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFCAB12Q6NXP0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFCAB12Q6NXP0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms