Protein–RNA interactions for Protein: Q659C4

LARP1B, La-related protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1BQ659C4 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LARP1BQ659C4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LARP1BQ659C4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms