Protein–RNA interactions for Protein: Q5W188

CST9LP1, Putative cystatin-9-like protein CST9LP1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST9LP1Q5W188 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CST9LP1Q5W188 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CST9LP1Q5W188 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms