Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUE5

C1orf53, Uncharacterized protein C1orf53, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf53Q5VUE5 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C1orf53Q5VUE5 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
C1orf53Q5VUE5 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms