Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU26

COLEC12, Collectin-12, humanhuman

Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLEC12Q5KU26 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
COLEC12Q5KU26 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
COLEC12Q5KU26 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms