Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SBK1Q52WX2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SBK1Q52WX2 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms