Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
KLHL38Q2WGJ6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
KLHL38Q2WGJ6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms