Protein–RNA interactions for Protein: Q16821

PPP1R3A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3A, humanhuman

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Length 1,122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R3AQ16821 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PPP1R3AQ16821 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
PPP1R3AQ16821 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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