Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SGCBQ16585 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
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