Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NECTIN1Q15223 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NECTIN1Q15223 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
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