Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 NT5C3B-212ENST00000495317 836 ntTSL 523.37■■□□□ 1.331e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-216ENST00000523903 1534 ntTSL 1 (best)21.6■■□□□ 1.051e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-209ENST00000476921 1081 ntTSL 320.32■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-201ENST00000393910 1253 ntTSL 220.32■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-208ENST00000475053 675 ntTSL 320.32■□□□□ 0.841e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-204ENST00000445655 922 ntTSL 220.1■□□□□ 0.811e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-205ENST00000460893 964 ntTSL 319.08■□□□□ 0.641e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.541e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-206ENST00000469698 1573 ntTSL 317.57■□□□□ 0.41e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-202ENST00000415460 730 ntTSL 516.79■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.849e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.759e-7■■■■■ 41.8
EFTUD2Q15029 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.282e-9■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 VEGFA-221ENST00000520265 336 ntTSL 513.53□□□□□ -0.243e-11■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 SAP130-205ENST00000450957 559 ntTSL 420.16■□□□□ 0.821e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.171e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.078e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-207ENST00000481352 1725 ntTSL 515.04■□□□□ -08e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-206ENST00000455605 1882 ntTSL 512.74□□□□□ -0.378e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-202ENST00000372344 1119 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.618e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 POLR1C-208ENST00000488601 973 ntTSL 24.68□□□□□ -1.668e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 BOP1-203ENST00000569160 734 ntTSL 213.69□□□□□ -0.226e-9■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.574e-11■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 CPNE7-203ENST00000525982 576 ntTSL 520.88■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 516.19■□□□□ 0.186e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.156e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-211ENST00000561430 508 ntTSL 215.93■□□□□ 0.148e-8■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-208ENST00000495420 707 ntTSL 215.92■□□□□ 0.141e-6■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 314.38□□□□□ -0.116e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 MACROD1-207ENST00000543422 403 ntTSL 314.33□□□□□ -0.124e-11■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.176e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-209ENST00000495764 504 ntTSL 513.99□□□□□ -0.171e-6■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 59.46□□□□□ -0.896e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 ALDH18A1-203ENST00000483788 750 ntTSL 319.01■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 UBA52-212ENST00000599256 927 ntTSL 222.13■■□□□ 1.135e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 UBA52-211ENST00000598814 550 ntTSL 1 (best)14.4□□□□□ -0.15e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 GAK-204ENST00000504435 4346 ntTSL 212.16□□□□□ -0.465e-7■■■■■ 41.7
EFTUD2Q15029 SLC22A7-205ENST00000449231 933 ntTSL 515.19■□□□□ 0.023e-8■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.184e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 FOXK2-202ENST00000473637 3462 ntTSL 1 (best)20.39■□□□□ 0.854e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 213.52□□□□□ -0.251e-6■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.315e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-202ENST00000339643 633 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.865e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-213ENST00000509582 716 ntTSL 39.57□□□□□ -0.885e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-209ENST00000369016 923 ntTSL 5 BASIC8.07□□□□□ -1.125e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.135e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-201ENST00000271690 2818 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.58□□□□□ -1.25e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-215ENST00000638926 360 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.215e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-207ENST00000362052 703 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.345e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-212ENST00000505321 552 ntTSL 55.75□□□□□ -1.495e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.4□□□□□ -1.545e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.48□□□□□ -1.855e-11■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ACTB-206ENST00000443528 569 ntTSL 415.13■□□□□ 0.012e-36■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 ACTB-202ENST00000414620 561 ntTSL 414.52□□□□□ -0.092e-36■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.063e-6■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 GDPD3-201ENST00000360688 1306 ntTSL 1 (best)13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.231e-15■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.231e-15■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SAT1-209ENST00000489394 1135 ntTSL 210.41□□□□□ -0.741e-15■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SAT1-206ENST00000463236 735 ntTSL 36.22□□□□□ -1.411e-15■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SF3B2-203ENST00000524627 841 ntTSL 311.77□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STXBP2-210ENST00000595950 552 ntTSL 521.33■■□□□ 1.018e-8■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STXBP2-204ENST00000593535 549 ntTSL 412.12□□□□□ -0.478e-8■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 PNPLA2-205ENST00000531923 637 ntTSL 221.66■■□□□ 1.062e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.972e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SCARB1-206ENST00000539320 720 ntTSL 220.77■□□□□ 0.922e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SCARB1-210ENST00000545493 581 ntTSL 219.79■□□□□ 0.762e-7■■■■■ 41.6
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EFTUD2Q15029 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.72e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 NUDT14-205ENST00000550912 541 ntTSL 319.17■□□□□ 0.662e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-214ENST00000586456 545 ntTSL 218.83■□□□□ 0.62e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.512e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.52e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 AKT1-216ENST00000556836 592 ntTSL 417.97■□□□□ 0.472e-13■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 AKT1-218ENST00000557552 8396 ntTSL 517.81■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 AKT1-204ENST00000544168 1564 ntTSL 217.5■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.392e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.372e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.352e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.322e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.292e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 UBXN6-210ENST00000593024 629 ntTSL 216.64■□□□□ 0.252e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.242e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.234e-10■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.232e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 KIAA1524-205ENST00000487834 2014 ntTSL 1 (best)16.45■□□□□ 0.222e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.152e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 UBXN6-208ENST00000592358 626 ntTSL 215.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.112e-7■■■■■ 41.6
EFTUD2Q15029 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 41.6
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