Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NCAPHQ15003 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NCAPHQ15003 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
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