Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CUL4BQ13620 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CUL4BQ13620 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
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