Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATRQ13535 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ATRQ13535 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRQ13535 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRQ13535 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ATRQ13535 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ATRQ13535 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
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