Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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MSLNQ13421 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
MSLNQ13421 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
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