Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CBX3Q13185 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
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