Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
FOXF2Q12947 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
FOXF2Q12947 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
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