Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
LMOD3Q0VAK6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
LMOD3Q0VAK6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms