Protein–RNA interactions for Protein: Q09472

EP300, Histone acetyltransferase p300, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP300Q09472 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EP300Q09472 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EP300Q09472 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EP300Q09472 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EP300Q09472 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EP300Q09472 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EP300Q09472 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
EP300Q09472 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
EP300Q09472 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EP300Q09472 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EP300Q09472 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.6 ms