Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RBBP4Q09028 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RBBP4Q09028 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms