Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CYP4F3Q08477 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CYP4F3Q08477 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms