Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
GABPAQ06546 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GABPAQ06546 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms