Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC35.6■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
ERCC6Q03468 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC35.57■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
ERCC6Q03468 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms