Protein–RNA interactions for Protein: Q02878

RPL6, 60S ribosomal protein L6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL6Q02878 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RPL6Q02878 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RPL6Q02878 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms