Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CDKL1Q00532 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CDKL1Q00532 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms