Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IRX3P78415 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
IRX3P78415 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IRX3P78415 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRX3P78415 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRX3P78415 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRX3P78415 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRX3P78415 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IRX3P78415 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX3P78415 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
IRX3P78415 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms