Protein–RNA interactions for Protein: P61576

HERV-K104, Endogenous retrovirus group K member 104 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERV-K104P61576 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERV-K104P61576 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms