Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
POLR2FP61218 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms