Protein–RNA interactions for Protein: P59665

DEFA1, Neutrophil defensin 1, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA1P59665 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
DEFA1P59665 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
DEFA1P59665 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms