Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NAP1L1P55209 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NAP1L1P55209 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms