Protein–RNA interactions for Protein: P51159

RAB27A, Ras-related protein Rab-27A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB27AP51159 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RAB27AP51159 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RAB27AP51159 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms