Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TAF6P49848 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TAF6P49848 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TAF6P49848 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TAF6P49848 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TAF6P49848 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms