Protein–RNA interactions for Protein: P49711

CTCF, Transcriptional repressor CTCF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFP49711 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CTCFP49711 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CTCFP49711 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTCFP49711 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTCFP49711 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
CTCFP49711 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CTCFP49711 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CTCFP49711 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CTCFP49711 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CTCFP49711 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms