Protein–RNA interactions for Protein: P45378

TNNT3, Troponin T, fast skeletal muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3P45378 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNNT3P45378 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNNT3P45378 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms