Protein–RNA interactions for Protein: P39900

MMP12, Macrophage metalloelastase, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP12P39900 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MMP12P39900 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MMP12P39900 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
MMP12P39900 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MMP12P39900 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP12P39900 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP12P39900 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP12P39900 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP12P39900 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
MMP12P39900 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms