Protein–RNA interactions for Protein: P31644

GABRA5, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA5P31644 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
GABRA5P31644 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GABRA5P31644 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms