Protein–RNA interactions for Protein: P30279

CCND2, G1/S-specific cyclin-D2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCND2P30279 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND2P30279 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND2P30279 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND2P30279 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND2P30279 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND2P30279 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCND2P30279 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCND2P30279 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCND2P30279 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCND2P30279 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms