Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTFRP26992 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms