Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PTAFRP25105 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTAFRP25105 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms